Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPOCD1Q6ZMY3 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms