Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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