Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 AL354707.1-201ENST00000615168 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 EXTL2-207ENST00000535414 3146 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms