Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms