Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms