Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 AL354707.1-201ENST00000615168 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 GSTM3-201ENST00000256594 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 AL033529.1-201ENST00000480336 3447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 IRAK1-202ENST00000369974 3319 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 GCM1-201ENST00000259803 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 NR4A1-201ENST00000243050 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 ANKRD49-210ENST00000544612 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 MATR3-227ENST00000618441 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 MEP1A-201ENST00000230588 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 TJAP1-202ENST00000372444 2778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 TJAP1-203ENST00000372445 2751 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 UBTFL8-201ENST00000426903 2112 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms