Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms