Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms