Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 FAM155A-201ENST00000375915 8503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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VAMP3Q15836 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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VAMP3Q15836 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 ARFGEF1-201ENST00000262215 7225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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VAMP3Q15836 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
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VAMP3Q15836 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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VAMP3Q15836 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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VAMP3Q15836 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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VAMP3Q15836 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 SEMA4D-212ENST00000450295 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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