Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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