Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
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