Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
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NECTIN1Q15223 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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NECTIN1Q15223 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NECTIN1Q15223 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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