Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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