Protein–RNA interactions for Protein: Q14722

KCNAB1, Voltage-gated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB1Q14722 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNAB1Q14722 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNAB1Q14722 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNAB1Q14722 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNAB1Q14722 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNAB1Q14722 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNAB1Q14722 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNAB1Q14722 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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KCNAB1Q14722 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNAB1Q14722 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNAB1Q14722 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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KCNAB1Q14722 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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KCNAB1Q14722 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNAB1Q14722 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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KCNAB1Q14722 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNAB1Q14722 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNAB1Q14722 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNAB1Q14722 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNAB1Q14722 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNAB1Q14722 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNAB1Q14722 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNAB1Q14722 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNAB1Q14722 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNAB1Q14722 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNAB1Q14722 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNAB1Q14722 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNAB1Q14722 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNAB1Q14722 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNAB1Q14722 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNAB1Q14722 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNAB1Q14722 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNAB1Q14722 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNAB1Q14722 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNAB1Q14722 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNAB1Q14722 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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KCNAB1Q14722 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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KCNAB1Q14722 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNAB1Q14722 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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KCNAB1Q14722 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNAB1Q14722 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNAB1Q14722 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNAB1Q14722 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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KCNAB1Q14722 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNAB1Q14722 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNAB1Q14722 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNAB1Q14722 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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KCNAB1Q14722 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNAB1Q14722 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNAB1Q14722 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNAB1Q14722 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNAB1Q14722 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNAB1Q14722 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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KCNAB1Q14722 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNAB1Q14722 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNAB1Q14722 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNAB1Q14722 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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KCNAB1Q14722 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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KCNAB1Q14722 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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