Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
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SEMA3AQ14563 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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SEMA3AQ14563 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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SEMA3AQ14563 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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SEMA3AQ14563 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
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SEMA3AQ14563 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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