Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms