Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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