Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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