Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 AC093227.1-201ENST00000588040 1360 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 BCAS2P3-201ENST00000416374 767 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 ATP6V1B1-AS1-201ENST00000422761 1129 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 LINC02083-201ENST00000462835 515 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 AC008840.1-201ENST00000512486 809 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 AL512324.3-201ENST00000619383 882 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 KCNMB3-201ENST00000314235 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 FXR1-220ENST00000491062 1768 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
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MKRN4PQ13434 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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MKRN4PQ13434 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 AC025437.4-201ENST00000522975 681 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
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