Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
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