Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SP140Q13342 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SP140Q13342 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SP140Q13342 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SP140Q13342 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SP140Q13342 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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SP140Q13342 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SP140Q13342 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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SP140Q13342 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SP140Q13342 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SP140Q13342 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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SP140Q13342 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
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SP140Q13342 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SP140Q13342 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SP140Q13342 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SP140Q13342 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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SP140Q13342 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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SP140Q13342 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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SP140Q13342 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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SP140Q13342 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SP140Q13342 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SP140Q13342 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SP140Q13342 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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SP140Q13342 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SP140Q13342 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SP140Q13342 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SP140Q13342 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SP140Q13342 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SP140Q13342 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SP140Q13342 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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