Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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SGCGQ13326 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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SGCGQ13326 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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SGCGQ13326 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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SGCGQ13326 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
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