Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms