Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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