Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 SULT1A1-211ENST00000569554 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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