Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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