Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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