Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms