Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms