Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms