Protein–RNA interactions for Protein: Q04721

NOTCH2, Neurogenic locus notch homolog protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH2Q04721 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms