Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms