Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms