Protein–RNA interactions for Protein: Q01130

SRSF2, Serine/arginine-rich splicing factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF2Q01130 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRSF2Q01130 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms