Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms