Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms