Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LOXL3P58215 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LOXL3P58215 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LOXL3P58215 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LOXL3P58215 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LOXL3P58215 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LOXL3P58215 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LOXL3P58215 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LOXL3P58215 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LOXL3P58215 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LOXL3P58215 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LOXL3P58215 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LOXL3P58215 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LOXL3P58215 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LOXL3P58215 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LOXL3P58215 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LOXL3P58215 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LOXL3P58215 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LOXL3P58215 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LOXL3P58215 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LOXL3P58215 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LOXL3P58215 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LOXL3P58215 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LOXL3P58215 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LOXL3P58215 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LOXL3P58215 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LOXL3P58215 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LOXL3P58215 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LOXL3P58215 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LOXL3P58215 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LOXL3P58215 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LOXL3P58215 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LOXL3P58215 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LOXL3P58215 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LOXL3P58215 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LOXL3P58215 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LOXL3P58215 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LOXL3P58215 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LOXL3P58215 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LOXL3P58215 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LOXL3P58215 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LOXL3P58215 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LOXL3P58215 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LOXL3P58215 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LOXL3P58215 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LOXL3P58215 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms