Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.9 ms