Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AIF1P55008 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AIF1P55008 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AIF1P55008 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AIF1P55008 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AIF1P55008 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AIF1P55008 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AIF1P55008 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
AIF1P55008 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
AIF1P55008 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
AIF1P55008 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AIF1P55008 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
AIF1P55008 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AIF1P55008 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AIF1P55008 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AIF1P55008 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AIF1P55008 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AIF1P55008 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AIF1P55008 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AIF1P55008 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AIF1P55008 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AIF1P55008 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AIF1P55008 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AIF1P55008 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AIF1P55008 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AIF1P55008 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AIF1P55008 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AIF1P55008 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AIF1P55008 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AIF1P55008 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AIF1P55008 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AIF1P55008 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AIF1P55008 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AIF1P55008 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
AIF1P55008 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AIF1P55008 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AIF1P55008 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AIF1P55008 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
AIF1P55008 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AIF1P55008 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AIF1P55008 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AIF1P55008 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AIF1P55008 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AIF1P55008 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AIF1P55008 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AIF1P55008 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AIF1P55008 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AIF1P55008 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AIF1P55008 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AIF1P55008 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AIF1P55008 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AIF1P55008 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AIF1P55008 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AIF1P55008 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AIF1P55008 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AIF1P55008 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AIF1P55008 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AIF1P55008 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AIF1P55008 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AIF1P55008 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AIF1P55008 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AIF1P55008 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AIF1P55008 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AIF1P55008 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AIF1P55008 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AIF1P55008 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AIF1P55008 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AIF1P55008 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
AIF1P55008 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AIF1P55008 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AIF1P55008 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AIF1P55008 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AIF1P55008 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AIF1P55008 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
AIF1P55008 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AIF1P55008 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AIF1P55008 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AIF1P55008 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AIF1P55008 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AIF1P55008 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
AIF1P55008 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AIF1P55008 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AIF1P55008 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AIF1P55008 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AIF1P55008 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AIF1P55008 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AIF1P55008 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AIF1P55008 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AIF1P55008 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AIF1P55008 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
AIF1P55008 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AIF1P55008 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AIF1P55008 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AIF1P55008 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AIF1P55008 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AIF1P55008 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AIF1P55008 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AIF1P55008 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AIF1P55008 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AIF1P55008 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms