Protein–RNA interactions for Protein: P51787

KCNQ1, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1P51787 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNQ1P51787 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
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