Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms