Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSRP3P50461 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms