Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms