Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MDH1P40925 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MDH1P40925 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MDH1P40925 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MDH1P40925 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MDH1P40925 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MDH1P40925 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MDH1P40925 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MDH1P40925 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MDH1P40925 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MDH1P40925 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MDH1P40925 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MDH1P40925 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MDH1P40925 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MDH1P40925 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MDH1P40925 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MDH1P40925 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MDH1P40925 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MDH1P40925 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MDH1P40925 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MDH1P40925 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MDH1P40925 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MDH1P40925 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MDH1P40925 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MDH1P40925 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MDH1P40925 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MDH1P40925 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MDH1P40925 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MDH1P40925 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MDH1P40925 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MDH1P40925 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MDH1P40925 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MDH1P40925 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MDH1P40925 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MDH1P40925 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MDH1P40925 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MDH1P40925 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MDH1P40925 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MDH1P40925 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MDH1P40925 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MDH1P40925 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MDH1P40925 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MDH1P40925 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MDH1P40925 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MDH1P40925 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MDH1P40925 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MDH1P40925 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MDH1P40925 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MDH1P40925 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MDH1P40925 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MDH1P40925 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MDH1P40925 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MDH1P40925 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MDH1P40925 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MDH1P40925 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MDH1P40925 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MDH1P40925 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MDH1P40925 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MDH1P40925 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MDH1P40925 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MDH1P40925 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MDH1P40925 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MDH1P40925 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MDH1P40925 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MDH1P40925 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MDH1P40925 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MDH1P40925 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MDH1P40925 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MDH1P40925 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MDH1P40925 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MDH1P40925 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MDH1P40925 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MDH1P40925 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MDH1P40925 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MDH1P40925 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MDH1P40925 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MDH1P40925 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MDH1P40925 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MDH1P40925 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MDH1P40925 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MDH1P40925 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MDH1P40925 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MDH1P40925 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MDH1P40925 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MDH1P40925 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MDH1P40925 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MDH1P40925 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MDH1P40925 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MDH1P40925 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MDH1P40925 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MDH1P40925 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MDH1P40925 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MDH1P40925 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MDH1P40925 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MDH1P40925 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MDH1P40925 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MDH1P40925 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MDH1P40925 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MDH1P40925 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MDH1P40925 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms