Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms