Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFNP31947 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFNP31947 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFNP31947 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFNP31947 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFNP31947 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFNP31947 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFNP31947 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFNP31947 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFNP31947 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SFNP31947 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SFNP31947 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFNP31947 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SFNP31947 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SFNP31947 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFNP31947 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFNP31947 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFNP31947 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFNP31947 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SFNP31947 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SFNP31947 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFNP31947 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SFNP31947 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFNP31947 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SFNP31947 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFNP31947 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFNP31947 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SFNP31947 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFNP31947 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SFNP31947 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFNP31947 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SFNP31947 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SFNP31947 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SFNP31947 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SFNP31947 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SFNP31947 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SFNP31947 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SFNP31947 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFNP31947 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SFNP31947 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SFNP31947 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SFNP31947 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFNP31947 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SFNP31947 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFNP31947 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SFNP31947 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SFNP31947 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SFNP31947 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFNP31947 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFNP31947 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SFNP31947 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFNP31947 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFNP31947 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFNP31947 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFNP31947 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFNP31947 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFNP31947 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFNP31947 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFNP31947 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFNP31947 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFNP31947 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFNP31947 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFNP31947 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFNP31947 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFNP31947 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFNP31947 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFNP31947 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFNP31947 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFNP31947 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFNP31947 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFNP31947 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFNP31947 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFNP31947 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SFNP31947 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFNP31947 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFNP31947 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFNP31947 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFNP31947 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFNP31947 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SFNP31947 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFNP31947 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFNP31947 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFNP31947 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFNP31947 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SFNP31947 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFNP31947 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFNP31947 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFNP31947 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFNP31947 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFNP31947 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SFNP31947 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFNP31947 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFNP31947 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFNP31947 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFNP31947 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFNP31947 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFNP31947 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFNP31947 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFNP31947 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFNP31947 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms