Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPS1P31327 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPS1P31327 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPS1P31327 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPS1P31327 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPS1P31327 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPS1P31327 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPS1P31327 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPS1P31327 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPS1P31327 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPS1P31327 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPS1P31327 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPS1P31327 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CPS1P31327 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CPS1P31327 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CPS1P31327 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPS1P31327 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPS1P31327 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CPS1P31327 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPS1P31327 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPS1P31327 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPS1P31327 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPS1P31327 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPS1P31327 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CPS1P31327 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPS1P31327 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPS1P31327 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPS1P31327 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPS1P31327 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPS1P31327 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPS1P31327 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPS1P31327 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPS1P31327 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPS1P31327 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPS1P31327 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPS1P31327 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPS1P31327 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPS1P31327 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPS1P31327 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPS1P31327 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CPS1P31327 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CPS1P31327 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPS1P31327 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPS1P31327 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPS1P31327 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPS1P31327 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPS1P31327 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPS1P31327 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPS1P31327 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPS1P31327 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPS1P31327 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPS1P31327 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPS1P31327 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CPS1P31327 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPS1P31327 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPS1P31327 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPS1P31327 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPS1P31327 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPS1P31327 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPS1P31327 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPS1P31327 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPS1P31327 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPS1P31327 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPS1P31327 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPS1P31327 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPS1P31327 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPS1P31327 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPS1P31327 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CPS1P31327 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPS1P31327 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CPS1P31327 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPS1P31327 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPS1P31327 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPS1P31327 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPS1P31327 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPS1P31327 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPS1P31327 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPS1P31327 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPS1P31327 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPS1P31327 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPS1P31327 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPS1P31327 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPS1P31327 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPS1P31327 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPS1P31327 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPS1P31327 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPS1P31327 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPS1P31327 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPS1P31327 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPS1P31327 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPS1P31327 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPS1P31327 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPS1P31327 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CPS1P31327 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CPS1P31327 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPS1P31327 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPS1P31327 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPS1P31327 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPS1P31327 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPS1P31327 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms