Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2E1P29083 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms