Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NFKBIAP25963 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms