Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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